Un equip d’investigadors de la Universitat de les Illes Balears (UIB) ha obtengut per primera vegada el genoma de referència del crustaci cavernícola Tethysbaena scabra, endèmic de les illes de Menorca i Mallorca. Aquest avenç obre noves portes a la investigació biològica i a la conservació de la biodiversitat subterrània, a la vegada que permetrà posicionar a l'arbre de la vida aquest ordre taxonòmic, Thermosbenacea, i comprendre l'evolució de la biodiversitat a la Terra.

L’estudi ha estat publicat a la plataforma de ciència oberta F1000Research i s’emmarca dins els objectius de la Iniciativa Catalana per a l'Earth Biogenome project (CBP), que forma part de les iniciatives europees European Reference Genome Atlas (ERGA) i internacionals Earth BioGenome Project (EBP). Aquestes iniciatives tenen com a objectiu seqüenciar tots els animals i plantes del planeta. També ha comptat amb el suport del Govern de les Illes Balears.

«Aquest és un gran pas endavant per a la bioinformàtica i la genòmica a les Illes Balears, i contribueix a consolidar el paper creixent de la Universitat de les Illes Balears en l’àmbit de la genòmica i la bioinformàtica evolutiva, atès que és el primer genoma complet generat íntegrament per un grup de recerca bioinformàtica a les Illes Balears. No només es generen dades d’alta qualitat, sinó que contribuïm activament a entendre l’evolució d’un dels grups més diversos del planeta: els artròpodes», assegura l’investigador José Antonio Jurado, que ha liderat aquesta iniciativa.

L'ordre Thermosbaenacea, poc conegut i amb poques espècies descrites, ocupa una posició clau per entendre l’evolució dels artròpodes. El genoma de Tethysbaena scabra proporcionarà una base fonamental per a estudis comparatius i per desxifrar l'origen i les adaptacions de la fauna subterrània.

Tecnologia i ciència local al servei de la biodiversitat

Gràcies a l’aplicació de tecnologies de seqüenciació de nova generació i eines avançades d’anàlisi bioinformàtica, el grup ha generat un genoma d’alta qualitat, amb una cobertura extensa i una anotació estructural i repetitiva detallada.

Amb aquest model, es facilita la comparativa amb altres genomes de crustacis i es poden estudiar mecanismes evolutius únics i adaptacions genètiques a condicions ecològiques extremes. A més, aporta eines genòmiques per a futurs plans de conservació de la fauna subterrània al Mediterrani.

Aquest avanç consolida la capacitat de la Universitat de les Illes Balears per dur a terme projectes genòmics d’abast internacional. Aquesta recerca s’emmarca en l’estratègia de la UIB per impulsar les ciències òmiques i posicionar la Universitat com a referent en biodiversitat genòmica, a la vegada que contribueix al coneixement i la protecció de la fauna endèmica de les Illes i dels ambients subterranis mediterranis.

Equip investigador

L’equip investigador l’ha liderat el doctor José Antonio Jurado, professor del Departament de Biologia de la Universitat de les Illes Balears, i en formen part els doctors Carlos Juan i Joan Pons, genetistes i investigadors de l’IMEDEA (CSIC-UIB), el doctor Damià Jaume, taxònom i investigador de l’IMEDEA (CSIC-UIB), i les bioinformàtiques Laura Triginer i Karen Diana Schöninger, del Centre Balear de Biodiversitat. La majoria són membres del projecte internacional Earth Biogenome Project.